Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc1Q80VQ1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms