Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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