Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NischQ80TM9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
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