Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrc2bQ7TPM1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrc2bQ7TPM1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms