Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim27Q62158 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim27Q62158 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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