Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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