Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms