Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms