Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm27Q5SFM8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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