Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms