Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f8Q58FA4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f8Q58FA4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f8Q58FA4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f8Q58FA4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f8Q58FA4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f8Q58FA4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f8Q58FA4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f8Q58FA4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f8Q58FA4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f8Q58FA4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f8Q58FA4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f8Q58FA4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms