Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UPC7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UPC7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms