Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Usp19Q3UJD6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Usp19Q3UJD6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Usp19Q3UJD6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Usp19Q3UJD6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Usp19Q3UJD6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Usp19Q3UJD6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Usp19Q3UJD6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp19Q3UJD6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp19Q3UJD6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp19Q3UJD6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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