Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Parp8Q3UD82 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms