Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LbrQ3U9G9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms