Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms