Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Fndc4Q3TR08 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Fndc4Q3TR08 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms