Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ctdnep1Q3TP92 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ctdnep1Q3TP92 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ctdnep1Q3TP92 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ctdnep1Q3TP92 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ctdnep1Q3TP92 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ctdnep1Q3TP92 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ctdnep1Q3TP92 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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