Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms