Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim71Q1PSW8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms