Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms