Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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