Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms