Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms