Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms