Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Kcnb1Q03717 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms