Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GscQ02591 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GscQ02591 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GscQ02591 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GscQ02591 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms