Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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RykQ01887 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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RykQ01887 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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RykQ01887 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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RykQ01887 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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RykQ01887 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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RykQ01887 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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