Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms