Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms