Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Psmb4P99026 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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