Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lama4P97927 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lama4P97927 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lama4P97927 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lama4P97927 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lama4P97927 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lama4P97927 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lama4P97927 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms