Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
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Mesp1P97309 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms