Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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