Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rab3cP62823 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab3cP62823 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms