Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P58686 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P58686 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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