Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ctdsp1P58466 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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