Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MipP51180 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MipP51180 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MipP51180 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MipP51180 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MipP51180 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MipP51180 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MipP51180 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MipP51180 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MipP51180 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MipP51180 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MipP51180 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MipP51180 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MipP51180 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MipP51180 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MipP51180 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MipP51180 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms