Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms