Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms