Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VdrP48281 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VdrP48281 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VdrP48281 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VdrP48281 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VdrP48281 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VdrP48281 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
VdrP48281 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VdrP48281 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VdrP48281 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VdrP48281 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VdrP48281 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VdrP48281 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VdrP48281 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VdrP48281 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VdrP48281 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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VdrP48281 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VdrP48281 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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VdrP48281 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VdrP48281 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VdrP48281 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VdrP48281 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VdrP48281 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VdrP48281 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VdrP48281 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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VdrP48281 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VdrP48281 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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