Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ItgavP43406 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ItgavP43406 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.3 ms