Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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LtbP41155 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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LtbP41155 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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LtbP41155 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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LtbP41155 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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LtbP41155 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LtbP41155 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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LtbP41155 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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LtbP41155 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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LtbP41155 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LtbP41155 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms