Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab20P35295 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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