Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2afxP27661 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms