Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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