Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pou3f1P21952 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms