Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcer1aP20489 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms