Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NefhP19246 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NefhP19246 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NefhP19246 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NefhP19246 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms