Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RhoP15409 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RhoP15409 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhoP15409 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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